Team Instance

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    "description": "Cette structure a été créée à l'initiative de l'INCa dans le cadre de sa participation à l'\"International  Cancer Genome Consortium\" (ICGC).\r\n \r\nElle a trois missions :\r\n1 collecter ou préparer puis valider les acides nucléiques (ADN normal, ADN tumoral, ARN tumoral,...)  qui   seront   examinés   avec   les   techniques   de  la  génomique:   puce   de  génotypage,   puce d'expression, RNA-­seq, DNA-­‐eq en génomes complets et en éxomes),\r\n2 assurer la liaison avec les centres de génomique (académiques  ou privés) réalisant le séquençage haut-­‐débit,\r\n3 effectuer l'analyse des données de séquence transmises par ces centres de manière à en extraire l'information  (variants  somatiques  et  structuraux,  nombre  de  copie,  niveaux  d'expression  en RNA-­‐seq) utile aux équipes biomédicales.\r\n \r\nPour  remplir  sa  mission,  la  plateforme  a  développé  une  application  Internet  permettant  d'assurer  la gestion  de grands  projets  multicentriques  en toute  transparence  pour  les collaborateurs.  Elle  a mis en place  des  procédures  de  contrôle  qualité  des  échantillons  à  analyser.  Elle  dessine  et  automatise  des pipelines d'analyse pour les données de génomique qu'elle reçoit.",
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