{"id":5,"name":"INCa-SLC","logo_url":null,"description":"Cette structure a été créée à l'initiative de l'INCa dans le cadre de sa participation à l'\"International  Cancer Genome Consortium\" (ICGC).\r\n \r\nElle a trois missions :\r\n1 collecter ou préparer puis valider les acides nucléiques (ADN normal, ADN tumoral, ARN tumoral,...)  qui   seront   examinés   avec   les   techniques   de  la  génomique:   puce   de  génotypage,   puce d'expression, RNA-­seq, DNA-­‐eq en génomes complets et en éxomes),\r\n2 assurer la liaison avec les centres de génomique (académiques  ou privés) réalisant le séquençage haut-­‐débit,\r\n3 effectuer l'analyse des données de séquence transmises par ces centres de manière à en extraire l'information  (variants  somatiques  et  structuraux,  nombre  de  copie,  niveaux  d'expression  en RNA-­‐seq) utile aux équipes biomédicales.\r\n \r\nPour  remplir  sa  mission,  la  plateforme  a  développé  une  application  Internet  permettant  d'assurer  la gestion  de grands  projets  multicentriques  en toute  transparence  pour  les collaborateurs.  Elle  a mis en place  des  procédures  de  contrôle  qualité  des  échantillons  à  analyser.  Elle  dessine  et  automatise  des pipelines d'analyse pour les données de génomique qu'elle reçoit.","expertise":[],"expertise_description":"","linkCovid19":"","homepage":"http://www.synergielyoncancer.fr/","unitId":"","address":"28 rue Laënnec\r\nFondation Synergie Lyon Cancer, Bât. Cheney D\r\n69008 Lyon\r\nFrance","city":"Lyon","country":"France","communities":[],"projects":[],"affiliatedWith":[],"publications":[""],"certifications":[],"fundedBy":[{"id":4,"name":"IFB - ELIXIR-FR","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IFB%20-%20ELIXIR-FR/?format=json"}],"keywords":[],"fields":["Biomédical","Biologie"],"orgid":null,"tools":[],"services":[],"leaders":[],"deputies":[],"scientificLeaders":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/629/?format=json"],"technicalLeaders":[],"members":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/335/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/505/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/38/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/218/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/364/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/568/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/579/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/603/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/606/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/620/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/629/?format=json"],"maintainers":[],"ifbMembership":"None","platforms":[],"is_active":false,"closing_date":"2023-03-15","lat":"45.735673","lng":"4.887571","updated_at":"2025-10-21T13:07:13.251070Z"}