Dans le cadre de la formation permanente des formations sont proposées aux personnels des divers instituts. Les formations couvrent divers aspects allant de la méthodologie bioinformatique à la maîtrise des environnements et des langages informatiques.
Les formations dispensées sont les suivantes :
- Introduction bioinformatique
- Introduction au système Linux et à SGE
- Développement : Perl, Python
- Galaxy:  utilisation, intégration d'outils, workflows, analyse RADseq
- Environnement ISAtools
- Environnement HubZero