Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module Analyses ChIP-seq (sous Galaxy)- version 2023
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Description
Bilille, la plateforme de bioinformatique, biostatistique et bioanalyse de la métropole lilloise, propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
Ce cycle est composé des modules suivants, à la carte :
- Analyses ADN
- Analyses de variants
- Métagénomique
- Analyses ChIP-seq
- Analyses RNA-seq
Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module Analyses ChIP-seq sont :
Savoir analyser des données de ChIP-seq, du peak-calling à la découverte de motifs :
- Savoir détecter les pics et obtenir un signal
- Comprendre les différentes structures de données
- Savoir effectuer les contrôles qualité
- Savoir effectuer une analyse d’enrichissement de motifs
- Etre capable de préparer ses résultats pour leur annotation
- Comprendre comment croiser plusieurs résultats de ChIP-seq