L’objectif de cette formation est de se familiariser avec les étapes et les outils d’analyse de données métatranscriptomiques dans le but de comprendre les fonctions d’une communauté microbienne. Nous proposons au personnel non-bioinformaticien de les accompagner dans la prise en main de ces étapes en utilisant la plateforme de bio-analyse Galaxy.
Après une introduction à la métatranscriptomique, une session pratique sur la plateforme Galaxy couvrira comment : - assigner des taxons à des données de métatranscriptomiques, - extraire des informations fonctionnelles au sein de données de métatranscriptomiques, - combiner informations taxonomiques et fonctionnelles pour faciliter la compréhension des fonctions d’une communauté microbienne