Objectifs pédagogiques

A l’issue de la formation, les stagiaires seront capables de :

connaître les éléments avancés du langage de programmation Python,
les appliquer sur des cas concrets en bioinformatique,
être autonome dans la mise en place de tâches complexes visant à extraire et re-formater des données issues de fichiers textes,
dans le cadre de traitement de données via le langage de programmation Python

Programme

Fonctions
Expressions régulières
Gestion des erreurs
Biopython
Quelques modules de bioinformatique
Réalisation de programmes et de Notebooks Jupyter
Illustration avec des exercices de manipulation de fichiers de séquences