Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module Métagénomique (sous Galaxy)- version 2023
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Description
Bilille, la plateforme de bioinformatique, biostatistique et bioanalyse de la métropole lilloise, propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
Ce cycle est composé des modules suivants, à la carte :
- Analyses ADN
- Analyses de variants
- Métagénomique
- Analyses ChIP-seq
- Analyses RNA-seq
Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module Métagénomique sont :
- Connaître les différentes méthodes de séquençage à haut débit pour la métagénomique, avec leurs avantages et leurs limites : métagénomique ciblée, métagénomique génomes entiers, métatranscriptomique
- Comprendre les différentes étapes analytiques du traitement bioinformatique des données et savoir les mettre en œuvre
- Savoir conduire une analyse statistique pour l’estimation de la richesse de la biodiversité
- Aller jusqu’aux conclusions biologiques