Cycle « Analyse de données de séquençage à haut-débit » - Module Analyses ADN (sous Galaxy)- version 2023
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Description
Bilille, la plateforme de bioinformatique, biostatistique et bioanalyse de la métropole lilloise, propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit.
Ce cycle est composé des modules suivants, à la carte :
- Analyses ADN
- Analyses de variants
- Métagénomique
- Analyses ChIP-seq
- Analyses RNA-seq
Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.

Les objectifs du module Analyses ADN sont :
- Apprendre à manipuler des données de séquençage d’ADN
- Réaliser des contrôles de qualité et du nettoyage des lectures
- Présenter les méthodes et outils d'alignement
- Réaliser des contrôles de qualité et des alignements sur une référence
- Introduction à l’assemblage des lectures sans référence
- Utiliser la plateforme Galaxy pour ces analyses