L’objectif de cette formation est de se familiariser à l’utilisation de la ligne de commande pour un usage sur un cluster de
calcul afin d’acquérir les bases pour le traitement de données biologiques.
Présentation de l’infrastructure du cluster de calcul du Mésocentre Clermont Auvergne.
Introduction à l’environnement Linux.
Initiation à un langage de scripting avec le shell Bash.
Manipulation en ligne de commande de fichiers de données d'origine biologique.
Comment se connecter au serveur de calcul.
Apprentissage du langage informatique Bash et comment naviguer dans un environnement Linux.
Exercices pratiques de saisie de commandes sur un terminal sans interface graphique.
Apprentissage de la gestion de fichiers, comment les créer, gérer les droits d’accès, les manipuler et les transférer sur le
cluster de calcul ou les récupérer sur son poste de travail local.