Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 4/4 : Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire
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Description
Bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheur·euses, enseignant·es-chercheur·euses, ingénieur·es, technicien·nes et doctorant·es en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.
Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours:
- Banques de données et BLAST
- Alignement de séquences
- Prédiction de gènes et annotation de protéines
- Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire
Ces modules peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.
Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de Bilille.
Les objectifs du module 4 sont :
- Comprendre les grands principes de l’évolution moléculaire et de la reconstruction phylogénétique
- Savoir construire des alignements informatifs pour une analyse phylogénétique
- Comprendre les modèles phylogénétiques probabilistes, les méthodes d'inférence et savoir les appliquer
- Savoir reconstruire des arbres phylogénétiques en Maximum de vraisemblance (ML) et par Inférence Bayésienne (BI)
- Etre capable d’analyser avec un regard critique les résultats obtenus