Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 3/4 : Prédiction de gènes et annotation de protéines
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Description
Bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheur·euses, enseignant·es-chercheur·euses, ingénieur·es, technicien·nes et doctorant·es en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.
Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours:
- Banques de données et BLAST
- Alignement de séquences
- Prédiction de gènes et annotation de protéines
- Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire
Ces modules peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.
Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de Bilille.
Les objectifs du module 3 sont :
- découvrir les logiciels liés à la prédiction de gènes et à l'annotation de protéines
- acquérir la méthodologie pour prédire les gènes présents sur un génome qu'il soit bactérien ou eucaryote
- acquérir la méthodologie pour analyser la séquence protéique prédite et en déduire la fonction possible de la protéine, avoir une idée de sa localisation cellulaire et de sa structure
- être capable d'analyser les résultats obtenus par les logiciels avec un regard critique