Cycle « Initiation à la bioinformatique » - Module 2/4 : Alignement de séquences
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Description
Bilille propose un cycle de découverte de la bioinformatique à destination des chercheur·euses, enseignant·es-chercheur·euses, ingénieur·es, technicien·nes et doctorant·es en biologie. Aucun pré-requis en informatique n'est attendu.
Le cycle est constitué de quatre modules de deux jours:
- Banques de données et BLAST
- Alignement de séquences
- Prédiction de gènes et annotation de protéines
- Initiation à la reconstruction phylogénétique en biologie moléculaire
Ces modules peuvent être suivis indépendamment, mais ont une cohérence. Suivre chaque module peut aider à une meilleure compréhension des modules suivants.
Les fiches descriptives des différents modules sont accessibles sur le site web de Bilille.
Les objectifs du module 2 sont :
- Découvrir les différents types d'alignement pour les séquences protéiques et nucléiques
- Savoir choisir le logiciel et les paramètres adaptés à une problématique (alignement local, global, multiple...)
- Comprendre les méthodes algorithmiques pour l'alignement de séquences
- Comprendre les paramètres des logiciels
- Etre capable d'analyser un résultat d'alignement avec un regard critique