Bilille, la plateforme de bioinformatique, biostatistique et bioanalyse de la métropole lilloise, propose chaque année un cycle de formation d'introduction à l'analyse des données de séquençage à haut débit. Ce cycle est composé des modules suivants, à la carte : - Analyses ADN - Analyses de variants - Métagénomique - Analyses ChIP-seq - Analyses RNA-seq Les fiches descriptives sont accessibles sur le site de bilille. Chaque module comprend des présentations générales et des séances pratiques sur ordinateur, avec Galaxy.
Les objectifs du module Analyses de variants sont : - Comprendre les grands principes de la détection de variants - Réaliser les différentes étapes du post-traitement des données d’alignement à la détection de variants - Adapter l’analyse en fonction du type de données NGS générées - Comprendre la structure des données de variants - Savoir annoter des variants - Etre capable d’interpréter une liste de variants grâce aux outils libres disponibles