Pipelines et méthodes bioinformatiques pour l'analyse de données de séquençage (NGS) - session Octobre 2023
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Description
Bilille propose des formations en partenariat avec CNRS Formation Entreprises à destination des chercheur-euse-s, enseignant-e-s-chercheur-euse-s, ingénieur-e-s, technicien-ne-s en biologie et médecine.

Objectifs :
- Comprendre les principes des méthodes d'analyse de données de séquençage à haut débit (NGS)
- Comprendre les paramètres des méthodes et leur impact sur les résultats
- Apprendre à identifier les outils d'analyse en fonction du jeu de données
- Être autonome pour analyser des données dans un gestionnaire de workflow comme Galaxy
- Savoir manipuler les fichiers de lecture de séquençage : extraction, préparation, filtrage / nettoyage
- Savoir évaluer la qualité des données de séquençage
- Savoir analyser des données de séquençage de génomes (avec ou sans génome de référence) et prendre du recul sur le protocole expérimental
- Savoir analyser des données de RNA-seq (avec ou sans génome de référence) et prendre du recul sur le protocole expérimental