Les domaines des sciences du vivant liés à l’analyse du génome ont vu au cours des dernières années une
accumulation explosive des données provenant des techniques de séquençage à haut débit. Les progrès accomplis ont
considérablement augmenté les possibilités expérimentales dans des domaines tels que la génomique (séquençage de
nouveaux génomes, variants génétiques), la transcriptomique (expression génétique, ARNs non codants) et les
interactions ADN-protéine (immuno-précipitation de chromatine) et modifications de la chromatine. AVIESAN organise
une troisième session de cette école dont les objectifs sont d’apporter aux biologistes des notions et une pratique leur
permettant d’appréhender le traitement et l’analyse des données de séquençage à haut débit en utilisant un
environnement logiciel convivial : Galaxy.
L’école comportera des séminaires introductifs, des cours et des travaux pratiques consacrés à l’initiation au traitement
des données de transcriptome (RNA-seq), d’interactome (ChIP-seq) et de variations génomiques (SNP, CNV). Les
participants disposant de données pourront discuter de leur plan d’analyse et effectuer les premières étapes de
traitement de leurs données au cours de la dernière journée.
L’école est une initiation à l’utilisation des outils bioinformatiques dans un environnement Galaxy, plateforme dédiée à
l’analyse des données de séquençage à haut débit. Cette formation est destinée aux biologistes (chercheurs,
doctorants, enseignants-chercheurs, ingénieurs, …) ayant déjà utilisé ou souhaitant utiliser ce type de données.