Connaître les bases de la modélisation moléculaire : modélisation par homologie, arrimage (docking) de ligands, mutations in silico. Une demi-journée dédiée à la modélisation de vos protéines d'intérêts.
Programme
- Visualiser : Connaître les bases de la visualisation des protéines en 3D avec PYmol. - Comprendre : Analyse des structures 3D de protéines (RX ou RMN). Recherche d'homologues avec HHpred, I-Tasser, etc... Modélisation par homologie avec Modeller, Phyre2. Principes et applications. - Prédire : Docking de ligands avec Autodock. Prédiction des mutations in silico. Principes et applications. L'accent sera mis sur les points forts et les limites des différents outils et la pratique avec de nombreux "hand- on tutorials" Plus une session dédiée : «bring your own protein».