Team List
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{ "count": 45, "next": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/?format=api&limit=20&offset=20&ordering=id", "previous": null, "results": [ { "id": 1, "name": "EBIO", "logo_url": null, "description": "La plateforme Bioinformatique eBio (http://ebio.u-psud.fr/) créée en décembre 2009, est au centre du dispositif de bioinformatique de l’Université Paris-Sud. Elle est associée aux services de bioinformatiques de l’INRA Moulon, de l’hôpital Paul Brousse et de Gustave Roussy. eBio est labellisée par IBISA/Reseau National des Plateformes Bioinformatiques (RENABI) et membre de l’Alliance des Plateformes Bioinformatiques d’Ile de France (APLIBIO). Le site principal de eBio est localisé au bat 400 de l'Université Paris–Sud et intégré à l'I2BC (UMR9198, Gif sur Yvette).\r\nLes missions d’eBio comprennent : (1) le soutien bioinformatique aux projets de recherche, (2) la mise à disposition de moyens de calcul et stockage, (3) le développement et la maintenance de serveurs web de bioinformatique et bases de données de génomique. La plateforme a accompagné ou hébergé plus de 50 projets de recherche depuis début 2010.\r\nLes principaux domaines d’expertise de la plateforme sont les suivants :\r\n- L’analyse de données RNA-seq, notamment la detection de transcrits non codants, transcrits alternatifs, l’analyse d’expression différentielle, le ribosome profiling\r\n- L’analyse des structures d’ARN (alignement, structure secondaire)\r\n- L’intégration de logiciels et de workflows d’analyse sous Galaxy\r\n- L’assemblage des génomes de bactéries/champignons, la détection de variants\r\n- La phylogénie moléculaire et l’analyse fonctionnelle par profil phylogénétique\r\n- L’annotation des génomes de bactéries, archées et champignons (séquences CRISPR, terminateurs de transcription, ARN régulateurs, minisatellites)\r\n- Le calcul distribué et sur cloud (déploiement de services d’analyse sur cluster et cloud académique)", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://ebio.u-psud.fr/", "unitId": "", "address": "15 rue George Clémenceau\r\n91000 Orsay\r\nFrance", "city": "Orsay", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA" ], "fundedBy": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Agro-alimentaire", "Environnement" ], "orgid": null, "tools": [ "crisprfinder", "erpin", "synttax" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/244/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/605/?format=api" ], "members": [ 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and clinical research, including clinical trials.\r\nIn all these domain, the platform also develop appropriate methods, implement tools and automatic pipelines, and package and release them publicly or grant on-line access to the community.\r\nSoftware optimisation for high-performance computing is also part of our know-how.\r\nFinally the platform has developed an experience in training biologists, clinicians and bioinformaticians in all above-mentionned fields", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://u900.curie.fr", "unitId": "", "address": "26 rue d’Ulm\r\n75005 Paris\r\nFrance", "city": "Paris", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Biotechnologie" ], "orgid": null, "tools": [ "nebula" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/32/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/569/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/306/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/170/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/421/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/13/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/32/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/79/?format=api", 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"http://edamontology.org/topic_0769", "http://edamontology.org/topic_2269" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "https://bilille.univ-lille.fr", "unitId": "UAR 2014 - US 41 - PLBS", "address": "Plateforme de bioinformatique et de biostatistique de Lille\r\nBâtiment Esprit, avenue Paul Langevin,\r\n59650 Vileneuve-d'Ascq", "city": "Lille", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 68, "name": "Pasteur Institute of Lille", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Pasteur%20Institute%20of%20Lille/?format=api" }, { "id": 66, "name": "University of Lille", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20of%20Lille/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" 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It is also connected to the EMBRC infrastructure, is part of the IBiSA network via the regional BioGenOuest project, and is ISO 9001: 2015 certified. Through its numerous interactions with research units,", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_3387" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://abims.sb-roscoff.fr/", "unitId": "", "address": "Place Georges Teissier - Station Biologique de Roscoff", "city": "Roscoff", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 65, "name": "SBR - Roscoff Marine Station", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/SBR%20-%20Roscoff%20Marine%20Station/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA", "ISO 9001" ], "fundedBy": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Agro-alimentaire", "Environnement" ], "orgid": null, "tools": [ "galaxy", "workflow4metabolomics" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/134/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/362/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/299/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/134/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/145/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/206/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/272/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/331/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/460/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/465/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/549/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/24/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/362/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/134/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.726769", "lng": "-3.987521", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.185144Z" }, { "id": 5, "name": "INCa-SLC", "logo_url": null, "description": "Cette structure a été créée à l'initiative de l'INCa dans le cadre de sa participation à l'\"International Cancer Genome Consortium\" (ICGC).\r\n \r\nElle a trois missions :\r\n1 collecter ou préparer puis valider les acides nucléiques (ADN normal, ADN tumoral, ARN tumoral,...) qui seront examinés avec les techniques de la génomique: puce de génotypage, puce d'expression, RNA-seq, DNA-‐eq en génomes complets et en éxomes),\r\n2 assurer la liaison avec les centres de génomique (académiques ou privés) réalisant le séquençage haut-‐débit,\r\n3 effectuer l'analyse des données de séquence transmises par ces centres de manière à en extraire l'information (variants somatiques et structuraux, nombre de copie, niveaux d'expression en RNA-‐seq) utile aux équipes biomédicales.\r\n \r\nPour remplir sa mission, la plateforme a développé une application Internet permettant d'assurer la gestion de grands projets multicentriques en toute transparence pour les collaborateurs. Elle a mis en place des procédures de contrôle qualité des échantillons à analyser. Elle dessine et automatise des pipelines d'analyse pour les données de génomique qu'elle reçoit.", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.synergielyoncancer.fr/", "unitId": "", "address": "28 rue Laënnec\r\nFondation Synergie Lyon Cancer, Bât. Cheney D\r\n69008 Lyon\r\nFrance", "city": "Lyon", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 4, "name": "IFB - ELIXIR-FR", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IFB%20-%20ELIXIR-FR/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical" ], "orgid": null, "tools": [], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/629/?format=api" ], "technicalLeaders": [], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/335/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/505/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/38/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/218/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/364/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/568/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/579/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/603/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/606/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/620/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/629/?format=api" ], "maintainers": [], "ifbMembership": "None", "platforms": [], "is_active": false, "closing_date": "2023-03-15", "lat": "45.735673", "lng": "4.887571", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.251070Z" }, { "id": 6, "name": "CBiB", "logo_url": "https://services.cbib.u-bordeaux.fr/utils/logo_cbib.png", "description": "Le CBiB est une installation bioinformatique de base qui donne accès à des ressources informatiques de haute performance, à l'analyse de données biologiques et à une expertise en programmation. Ces ressources permettent aux scientifiques et aux laboratoires privés de répondre aux besoins en bioinformatique de leurs recherches de manière efficace et rentable. Nous offrons des technologies de pointe pour travailler avec des données cliniques, translationnelles et de sciences fondamentales, de l'acquisition et du stockage à l'analyse et au partage. Nos ressources sont sécurisées et conformes aux normes. De quelques échantillons à plusieurs dizaines de milliers, le Centre de bio-informatique fournit des services complets d'analyse et d'intégration d'ADN, d'ARN, de métabolomique, de protéomique et de données d'images.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_3391", "http://edamontology.org/topic_3517", "http://edamontology.org/topic_3941", "http://edamontology.org/topic_0121", "http://edamontology.org/topic_0203", "http://edamontology.org/topic_0196", "http://edamontology.org/topic_0080", "http://edamontology.org/topic_0091", "http://edamontology.org/topic_3307" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "https://www.cbib.u-bordeaux.fr/", "unitId": "", "address": "146 Rue Léo Saignat\r\n33076 Bordeaux\r\nFrance", "city": "Bordeaux", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA", "ISO 9001", "CNOC (INRA)", "NF X50-900" ], "fundedBy": [ { "id": 91, "name": "University of Bordeaux", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20of%20Bordeaux/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Agro-alimentaire", "Environnement" ], "orgid": "057qpr032", "tools": [ "xeml-lab", "mix", "molligen", "tango", "xheinz" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/467/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/268/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/268/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/34/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/154/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/67/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/467/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/34/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/268/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "44.824860", "lng": "-0.608450", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.146400Z" }, { "id": 7, "name": "ATGC", "logo_url": "https://www.lirmm.fr/wp-content/uploads/sites/3/2025/11/ATGClogo_LIRMM-300x105-1.jpg", "description": "The bioinformatics platform ATGC is supported by a research team from LIRMM. It has the triple vocation of disseminating the bioinformatics tools developed within the Montpellier community, of encouraging collaborations between computer scientists and biologists, and of providing assistance to these researchers by setting up bioinformatics services directly related to their work. The tools it offers are accessible online free of charge. They can be downloaded and/or run on Cluster IO from Montpellier Mésocentre (ISDM). A major axis of the platform concerns evolutionary studies.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_3372" ], "expertise_description": "The ATGC platform aims to braodcast the software systems developed by MAB Team from LIRMM.\r\nThe MAB team (Methods and Algorithms for Bioinformatics) proposes mathematical and algorithmic methods (text and tree algorithms, combinatorial algorithms and optimization, probabilistic modeling, statistical machine learning) to address biological issues such as evolution, phylogeny, comparative genomics", "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.atgc-montpellier.fr/", "unitId": "UMR5506", "address": "860 rue Saint Priest", "city": "Montpellier", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 73, "name": "LIRMM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/LIRMM/?format=api" } ], "publications": [ "10.1007/978-3-642-00982-2_60", "10.1186/1471-2105-9-166", "10.1093/sysbio/syq002", "10.1093/oxfordjournals.molbev.a025808", "10.1080/10635150390235520", "10.1093/nar/gki352", "10.1093/bioinformatics/bti713", "10.1080/10635150600755453", "10.1080/10635150701639754", "10.1093/molbev/msn067", "10.1098/rstb.2008.0180", "10.1186/1471-2105-9-413", "10.1080/10635150600969872", "", "10.1093/sysbio/syq010", "10.1093/nar/gkn180" ], "certifications": [ "Label IBiSA" ], "fundedBy": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 99, "name": "University of Montpellier", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20of%20Montpellier/?format=api" } ], "keywords": [ "Phylogeny", "Evolution and Phylogeny", "Text mining", "Structural genomics" ], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Agro-alimentaire", "Environnement", "Biotechnologie" ], "orgid": null, "tools": [ "bionj", "compphy", "crac", "fastme", "lordec", "mpscan", "phylogeny.fr", "phyml" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/528/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/282/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/830/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/528/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/443/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/50/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/76/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/108/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/118/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/282/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/411/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/480/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/585/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/443/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/830/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "43.636878", "lng": "3.841811", "updated_at": "2025-11-27T13:24:55.215918Z" }, { "id": 8, "name": "BiGR", "logo_url": null, "description": "● Bioanalyses\r\nConception, définition de design expérimentaux en génomique (microarrays, NGS). Analyse de données génomiques (microarray et NGS)\r\n- Microarray :\r\n- Gene Expression (Agilent, Affymetrix)\r\n- CGH array\r\n- microRNA array\r\n- NGS (DNA-seq):\r\n- Détection de SNP (WES, WGS, TS)\r\n- Détection de variants structuraux (LOH, CNV)\r\n- ChipSeq\r\n- NGS (RNA-seq) :\r\n- Analyse différentielle\r\n- recherche de transcrit de fusion\r\n- recherche de splicing alternatif\r\n- detection de SNP par RNA-seq\r\n\r\n● Conseil / Support\r\nElaboration de cahier des charges pour des projets de recherche à composante \"bioinformatique\" : définition du projet bioinformatique, définition des compétences requises, rédaction de fiche de poste, recrutement de bioinformaticien, estimation du coût global. La plateforme peut se positionner en partenaire du projet ou en prestataire de service.\r\n\r\n● Formations\r\nOrganisation de formations généraliste en interne. Organisation de formations spécifiques, sur demande, dans les locaux des demandeurs (utilisation d’un logiciel, explication de méthodologie bioinformatique, statistiques)\r\n\r\n● R&D\r\nDéveloppement /Maintenance de pipelines d’analyse.\r\nDéveloppement à facon d’outils d’annotation / de visualisation de données NGS Développement de DB de données génomiques\r\nParticipation au developpement de DB en médecine personnalisée", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://gustaveroussy.fr/fr/content/plateforme-de-bioinformatique-activit%C3%A9s", "unitId": "", "address": "114 rue Edouard Vaillant\r\nUMS INSERM 23/CNRS 3655 AMMICA\r\n94800 Villejuif\r\nFrance", "city": "Villejuif", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical" ], "orgid": null, "tools": [], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/413/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/413/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/159/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/179/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/185/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/244/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/318/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/327/?format=api" ], "maintainers": [], "ifbMembership": "None", "platforms": [], "is_active": false, "closing_date": "2023-03-15", "lat": "48.794123", "lng": "2.346437", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.171252Z" }, { "id": 9, "name": "MicroScope", "logo_url": "https://mage.genoscope.cns.fr/microscope/web/pictures/GENOSCOPE-LABGeM_logo100.png", "description": "L'équipe LABGeM du CEA/Genoscope a développé MicroScope, une plateforme web pour l'analyse des génomes procaryotes et l'annotation fonctionnelle experte. MicroScope combine des outils et des interfaces graphiques pour analyser les génomes dans un contexte comparatif et métabolique. Cette plateforme fournit des données provenant de milliers de projets sur le génome ainsi que des expériences post-génomiques permettant aux utilisateurs d'améliorer la compréhension des fonctions des gènes. Des annotations d'experts sont continuellement rassemblées dans la base de données MicroScope, ce qui contribue à l'amélioration de la qualité des annotations du génome microbien. MicroScope peut être utilisé comme une ressource communautaire pour l'analyse comparative et l'annotation des génomes accessibles au public, mais aussi comme une ressource privée avec des droits d'accès limités aux données génomiques.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_0622", "http://edamontology.org/topic_3301", "http://edamontology.org/topic_0219" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "https://mage.genoscope.cns.fr/microscope/", "unitId": "", "address": "2, rue Gaston Crémieux, CP 5706", "city": "Evry", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 19, "name": "LABGeM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/LABGeM/?format=api" }, { "id": 62, "name": "CEA", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CEA/?format=api" }, { "id": 67, "name": "University Paris-Saclay", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20Paris-Saclay/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 71, "name": "University of Évry Val d'Essonne", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20of%20%C3%89vry%20Val%20d'Essonne/?format=api" }, { "id": 70, "name": "Genoscope", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Genoscope/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA", "France-Génomique", "ISO 9001", "NF X50-900" ], "fundedBy": [ { "id": 62, "name": "CEA", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CEA/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biomédical", "Agro-alimentaire", "Environnement", "Biotechnologie" ], "orgid": null, "tools": [ "MicroScope_platform" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/90/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/623/?format=api" ], "technicalLeaders": [], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/90/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/231/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/347/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/431/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/531/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/540/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/623/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/90/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/623/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.623991", "lng": "2.439719", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.065759Z" }, { "id": 10, "name": "MIGALE", "logo_url": "https://migale.inrae.fr/sites/default/files/migale-orange_0.png", "description": "La plateforme bioinformatique Migale est une équipe de l'unité de recherche INRAe MaIAGE (Mathématiques appliquées et informatique, du génome à l'environnement). Depuis 2003, elle fournit quatre types de services à la communauté des sciences de la vie : une infrastructure ouverte dédiée à l'analyse des données des sciences de la vie (500 Tb, 1000 CPU équivalents), la diffusion de l'expertise en bio-informatique (session annuelle de formation \"Bio-informatique par la pratique\"), la conception et le développement d'applications bioinformatiques (navigateur de génome, bases de données) et l'analyse de données en génomique, métagénomique et métatranscriptomique.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_0091", "http://edamontology.org/topic_2269" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "https://migale.inrae.fr", "unitId": "UR1404", "address": "Domaine de Vilvert\r\nUnité MaIAGE", "city": "Jouy-en-Josas", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 82, "name": "INRAE", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRAE/?format=api" }, { "id": 88, "name": "BioinfOmics", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/BioinfOmics/?format=api" }, { "id": 24, "name": "MaIAGE - Applied Mathematics and Computer Science from Genomes to the Environment", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/MaIAGE%20-%20Applied%20Mathematics%20and%20Computer%20Science%20from%20Genomes%20to%20the%20Environment/?format=api" } ], "publications": [ "10.3389/fimmu.2021.745535", "10.3389/fimmu.2021.742584", "10.1016/j.biortech.2021.126612", "10.3390/nu13113865", "10.1158/1055-9965.epi-21-0188", "10.1128/msystems.00558-21", "10.1038/s41598-021-96967-4", "10.1101/2021.08.18.456644", "10.1038/s41541-021-00351-2", "10.1007/978-1-0716-1641-3_11", "10.1016/j.jenvman.2021.112631", "", "10.1093/bib/bbab318" ], "certifications": [ "Label IBiSA", "France-Génomique", "ISO 9001", "CNOC (INRA)", "CATI - CTAI", "PF stratégique nationale INRA", "RIO" ], "fundedBy": [ { "id": 82, "name": "INRAE", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRAE/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Agro-alimentaire", "Environnement" ], "orgid": "05qdnns64", "tools": [ "gpcrautomodel", "show", "vast" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/561/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/396/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/396/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/473/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/743/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/422/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/744/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/745/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/116/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/561/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/415/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/630/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/396/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/561/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/422/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/743/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/744/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/745/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/630/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/473/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/415/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.763439", "lng": "2.171437", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.118659Z" }, { "id": 11, "name": "Pasteur HUB", "logo_url": "https://hub-portal.pasteur.cloud/logo-hub.png", "description": "Le centre de bioinformatique et de biostatistique est la partie service du département de biologie informatique. L’équipe du Hub comprend 50 experts en biostatistique et en bioinformatique. Créé en 2015, le C3BI comprend cinq unités de recherche en biologie computationnelle et le Hub de bioinformatique et biostatistique. La mission du centre est de développer la recherche méthodologique en bioinformatique et biostatistique, de donner une visibilité internationale à l'Institut Pasteur dans ce domaine, d'offrir un soutien aux unités de recherche expérimentale, et de développer les compétences informatiques et analytiques du campus. Les activités de la plateforme comprennent la participation à des projets de recherche et d'analyse, des missions sur le terrain au sein des unités et des plateformes du campus, des sessions de formation et d'enseignement ouvertes à nos partenaires, et fournissent un certain nombre de ressources à la communauté nationale et internationale. L’équipe du Hub et l’ensemble du département ont une longue expérience dans le développement de sites web (par exemple NGPhylogeny.fr), les calculs intensifs et la gestion des données de santé.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_3372" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "https://research.pasteur.fr/en/team/bioinformatics-and-biostatistics-hub/", "unitId": "", "address": "25 Rue du Dr Roux", "city": "Paris", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 48, "name": "Institut Pasteur", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Institut%20Pasteur/?format=api" } ], "publications": [ "", "10.21105/joss.00698", "10.1093/bioinformatics/btab070" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 48, "name": "Institut Pasteur", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Institut%20Pasteur/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical" ], "orgid": null, "tools": [ "edam-browser", "fqtools", "macsyfinder", "memhdx", "sartools", "shaman", "syntview", "VHRdb" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/432/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/432/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/251/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/461/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/73/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/432/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/184/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/408/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/414/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/379/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/432/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/73/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.840351", "lng": "2.310813", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.054323Z" }, { "id": 12, "name": "RPBS", "logo_url": "https://bioserv.rpbs.univ-paris-diderot.fr/static/img/logo_RPBS.png", "description": "RPBS est une plateforme dédiée à la bio-informatique structurelle. Elle propose : le développement de méthodes/protocoles de bio-informatique structurelle, l'hébergement de services et le déploiement en ligne de services du domaine, la formation et conseil dans le domaine et l’hébergement de calculs via PAAS.", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://bioserv.rpbs.univ-paris-diderot.fr/index.html", "unitId": "", "address": "35 rue Hélène Brion", "city": "Paris", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 28, "name": "University Paris-Cité", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20Paris-Cit%C3%A9/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA" ], "fundedBy": [ { "id": 28, "name": "University Paris-Cité", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20Paris-Cit%C3%A9/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Informatique" ], "orgid": null, "tools": [ "fpocket", "frog2", "hca", "hhalign-kbest", "interevdock2", "pep-fold", "pep-sitefinder", "sabbac" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/801/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/802/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/523/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/801/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/802/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/120/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/523/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/583/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/617/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/638/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/523/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.827664", "lng": "2.380355", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.178118Z" }, { "id": 13, "name": "MBI-DS4H", "logo_url": "https://mbi-ds4h.loria.fr/wp-content/uploads/2021/12/LOGOprovisoireMBI-DS4H-e1638376808693.png", "description": "La plateforme MBI signifie \"Modélisation des biomolécules et de leurs interactions\". Il s'agit essentiellement d'une plateforme de recherche offrant des services dans le cadre de projets scientifiques collaboratifs. Les principales activités de la plateforme concernent la modélisation 3D de protéines en interaction avec des ligands, des protéines, de l'ARN ou de l'ADN ss, ainsi que l'annotation fonctionnelle de biomolécules. Les programmes disponibles comprennent la simulation dynamique moléculaire (logiciel NAMD), l'arrimage rigide très rapide et les programmes de comparaison de formes, qui sont exécutés sur des grappes hybrides de CPU et de GPU. L'expertise en science des données, y compris l'exploration de données symboliques, l'apprentissage machine, l'analyse de graphes complexes, est également disponible pour la bio-informatique et les applications biomédicales.", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://mbi.loria.fr/", "unitId": "", "address": "615 Rue du Jardin Botanique\r\n54600 Villers-lès-Nancy\r\nFrance", "city": "Villers-lès-Nancy", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 72, "name": "Inria Nancy - Grand-Est research centre", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Inria%20Nancy%20-%20Grand-Est%20research%20centre/?format=api" }, { "id": 61, "name": "INRIA", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRIA/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 61, "name": "INRIA", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRIA/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical" ], "orgid": null, "tools": [ "hexserver" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/182/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/527/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/20/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/140/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/527/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/578/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/182/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/111/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/112/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/403/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/182/?format=api" ], "ifbMembership": "Associated Team", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.665526", "lng": "6.157679", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.076000Z" }, { "id": 14, "name": "BiGEst", "logo_url": "https://bigest.unistra.fr/images/logo_bigest.png", "description": "The BiGEst platform is a network of platforms and teams providing bioinformatics services in Strasbourg. It is supported by 8 facilities from CNRS, INSERM, and the University of Strasbourg: GMGM, IBMC, IBMP, ICube, IGBMC, INCI, IPHC, and LNCA.\r\nIts missions are to deploy a shared computing and storage infrastructure dedicated to bioinformatics, to provide scientific and technical expertises and to organize training sessions to the scientific community.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_2815", "http://edamontology.org/topic_3391", "http://edamontology.org/topic_3365", "http://edamontology.org/topic_0121", "http://edamontology.org/topic_3174", "http://edamontology.org/topic_0203", "http://edamontology.org/topic_3169", "http://edamontology.org/topic_0196", "http://edamontology.org/topic_3170", "http://edamontology.org/topic_3372" ], "expertise_description": "BigEst provides expertise, bioinformatics tools and resources, as well as data-mining algorithms focused on evolutionary and functional analyses across various application areas, including biomedical, plant, structural, yeast, and bacterial studies.", "linkCovid19": "", "homepage": "http://bigest.unistra.fr/", "unitId": "", "address": "300 boulevard Sébastien Brant\r\n67412 Illkirch Graffenstaden", "city": "Strasbourg", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 29, "name": "ICube - 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Grâce aux compétences de ce personnel dévoué et hautement qualifié, BiRD conseille, propose et développe des services bioinformatiques basés sur des données de séquençage à haut débit. Le BiRD possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et a développé des flux de travail bio-informatiques dédiés qui normalisent le traitement des données brutes jusqu'à leur importance biologique. Sur la base de ces expertises, nous proposons à nos utilisateurs des formations sur l'analyse des données ou les langages de programmation. Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance via plusieurs services et ouverte à tous les scientifiques, quelle que soit leur institution d'accueil.", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.pf-bird.univ-nantes.fr/", "unitId": "", "address": "IRS UN, 8 Quai Moncousu", "city": "Nantes", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 33, "name": "UMS BioCore", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/UMS%20BioCore/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 31, "name": "Institut du Thorax", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Institut%20du%20Thorax/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA" ], "fundedBy": [ { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Informatique" ], "orgid": null, "tools": [ "DEPIB", "microSysMics" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/69/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/520/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/54/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/237/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/596/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/69/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/54/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/106/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/279/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/520/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/237/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "47.209985", "lng": "-1.553544", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.090528Z" }, { "id": 17, "name": "GenOuest", "logo_url": "https://www.cesgo.org/genouesttest2/wp-content/uploads/sites/9/2017/03/cropped-GO-CMJN-1-e1488463243285.png", "description": "Hébergé à l'INRIA-IRISA, le centre GenOuest offre un environnement bio-informatique complet avec une infrastructure matérielle et logicielle, des bases de données publiques, des logiciels et des flux de travail, le tout avec le soutien associé. Le portefeuille technologique s'appuie sur plusieurs ressources informatiques (cluster, cloud, docker, portail de galaxie), des solutions de gestion de données (BioMAJ). Au cours des années, GenOuest a investi dans le développement d'outils centrés sur les données. Grâce au projet CeSGO, GenOuest propose un ensemble d'outils collaboratifs pour gérer au mieux les projets et les données scientifiques. GenOuest développe des applications bio-informatiques ainsi que la formation et le transfert technologique de nouveaux outils développés par les équipes de recherche de l'Institut.", "expertise": [ "http://edamontology.org/topic_3372", "http://edamontology.org/topic_0605", "http://edamontology.org/topic_3071", "http://edamontology.org/topic_0091", "http://edamontology.org/topic_3571" ], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "https://www.genouest.org/", "unitId": "", "address": "Campus de Beaulieu\r\n263 avenue du Général Leclerc", "city": "Rennes", "country": "France", "communities": [], "projects": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/project/ELIXIR-CONVERGE/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/project/ELIXIR-BIOCONTAINERS/?format=api" ], "affiliatedWith": [ { "id": 75, "name": "Inria Rennes - Bretagne Atlantique Research Centre", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/Inria%20Rennes%20-%20Bretagne%20Atlantique%20Research%20Centre/?format=api" }, { "id": 78, "name": "IRISA", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IRISA/?format=api" } ], "publications": [ "10.3390/IECE-10646", "10.1021/acs.jproteome.0c00904", "10.1186/s12915-020-00820-5", "10.1186/s13059-019-1772-6", "" ], "certifications": [ "Label IBiSA", "CNOC (INRA)" ], "fundedBy": [ { "id": 61, "name": "INRIA", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRIA/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Agro-alimentaire", "Environnement", "Biotechnologie" ], "orgid": null, "tools": [ "aphidbase", "askomics", "aureme", "autograph", "biomaj", "commet", "discosnp", "", "germonline", "gatb", "lepidodb", "logol", "mindthegap", "minia", "peppsy", "protomata", "rasta-bacteria", "reprogenomics_viewer" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/805/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/77/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/77/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/529/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/427/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/466/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/497/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/77/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.112000", "lng": "-1.674300", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.212248Z" }, { "id": 18, "name": "PRABI-HCL", "logo_url": null, "description": "To be completed...", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.lemonde.fr", "unitId": "", "address": "165 chemin du Grand Revoyet\r\nFaculté de Médecine Lyon Sud\r\n69310 Pierre Bénite\r\nFrance", "city": "Bénite", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 59, "name": "LBBE - 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L'expertise disponible à PRABI-AMSB couvre les domaines suivants : Données d'expression (RNA-seq), données d'interaction (ChIP-seq, Tap-tag/MS, Yeast Two Hybrid screens), métagénomique et métatranscriptomique, génomique et phylogénie comparées, assemblage et annotation de génomes et biologie des systèmes (réseaux métaboliques, d'interaction et de régulation des protéines).", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://amsb.prabi.fr", "unitId": "", "address": "16 rue Raphael Dubois\r\nBatiment Mendel (2ème étage)", "city": "Villeurbanne Cedex", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 76, "name": "University Lyon 1", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/University%20Lyon%201/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA", "France-Génomique" ], "fundedBy": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Environnement" ], "orgid": null, "tools": [], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/459/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/285/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/459/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/472/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/285/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/472/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/459/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/285/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "45.781337", "lng": "4.864753", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.018021Z" }, { "id": 20, "name": "PRABI-Lyon-Grenoble", "logo_url": null, "description": "Les thématiques de recherche du PRABI-Doua s’organisent autour d’un point de vue méthodologique, qui affirme l’importance de la modélisation tant mathématique qu’informatique et d’une perspective évolutive qui organise les recherches indépendamment du niveau d’organisation biologique. C’est dans la synergie entre des problématiques biologiques propres et des développements méthodologiques que naît la plus grande part des résultats scientifiques de cette composante. Parmi les thématiques abordées figurent en particulier:\r\nPhylogénie et évolution moléculaire.\r\nGénomique comparative (organismes eucaryotes et procaryotes).\r\nEléments transposables.\r\nIntreractions hôtes-parasites.\r\nStatistiques appliquées à l'écologie et l'évolution.\r\nAnalyse statistique de données en grandes dimensions pour la génomique.", "expertise": [], "expertise_description": "", "linkCovid19": "", "homepage": "http://doua.prabi.fr/main/index", "unitId": "", "address": "Université Claude Bernard – Lyon 1\r\n43 boulevard du 11 Novembre 1918\r\n69622 Villeurbanne\r\nFrance", "city": "Villeurbanne", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 59, "name": "LBBE - Laboratory of Biometry and Evolutionary Biology", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/LBBE%20-%20Laboratory%20of%20Biometry%20and%20Evolutionary%20Biology/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" } ], "keywords": [], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Agro-alimentaire", "Environnement" ], "orgid": null, "tools": [ "leBIBI", "seaview" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/489/?format=api" ], "technicalLeaders": [], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/190/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/263/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/311/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/329/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/345/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/352/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/382/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/412/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/163/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/425/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/71/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/80/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/155/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/572/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/577/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/442/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/485/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/498/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/590/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/203/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/222/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/229/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/271/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/546/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/600/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/104/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/220/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/489/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/628/?format=api" ], "maintainers": [], "ifbMembership": "None", "platforms": [], "is_active": false, "closing_date": "2023-03-15", "lat": "45.736972", "lng": "4.796028", "updated_at": "2025-10-21T13:07:13.059740Z" } ] }
