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{ "count": 45, "next": null, "previous": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/?format=api&limit=20&offset=20&ordering=homepage", "results": [ { "id": 18, "name": "PRABI-HCL", "logo_url": null, "description": "To be completed...", "expertise": [], "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.lemonde.fr", "unitId": "", "address": "165 chemin du Grand Revoyet\r\nFaculté de Médecine Lyon Sud\r\n69310 Pierre Bénite\r\nFrance", "city": "Bénite", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 34, "name": "UMR 5558", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/UMR%205558/?format=api" }, { "id": 59, "name": "LBBE", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/LBBE/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 4, "name": "IFB", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IFB/?format=api" } ], "keywords": [ "Aucun des termes ci-dessus ne convient" ], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Biotechnologie" ], "orgid": null, "tools": [], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/541/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/541/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/337/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/29/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/150/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/212/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/436/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/537/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/541/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/428/?format=api" ], "maintainers": [], "ifbMembership": "None", "platforms": [], "is_active": false, "closing_date": "2023-03-15", "lat": "45.702207", "lng": "4.808651", "updated_at": "2023-03-16T13:09:41.584686Z" }, { "id": 27, "name": "Orphanet", "logo_url": "https://www.orpha.net/build/images/logo-orphanet.png", "description": "Orphanet est une base de connaissances sur les maladies rares et les médicaments orphelins. Elle vise à répertorier et à générer des données sur les maladies rares afin d'améliorer le diagnostic, les soins et le traitement des patients. Le site web Orphanet vise à fournir des informations de qualité sur les maladies rares et à garantir l'égalité d'accès à la base de connaissances pour les chercheurs et dans l'ontologie des maladies rares d'Orphanet. Orphanet tient également à jour la nomenclature des maladies rares d'Orphanet (numéro ORPHA), essentielle pour améliorer la visibilité des maladies rares dans les systèmes d'information sur la santé et la recherche, en agissant comme vecteur d'interopérabilité.", "expertise": [], "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.orpha.net", "unitId": "", "address": "96 rue Didot", "city": "Paris", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 40, "name": "INSERM US14", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM%20US14/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "HON Code", "IRDiRC Recommended", "Autre" ], "fundedBy": [ { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "keywords": [ "Machine learning", "Web portals", "Ontologies", "Interfaces", "Interoperability", "Semantic web", "Integration of heterogeneous data", "Knowledge representation", "Data collection curation", "Data Integration", "Données", "Toolkit", "Databases and information systems", "Développements technologiques de l‘Information et de la Communication" ], "fields": [ "Biomédical" ], "orgid": null, "tools": [ "ordo" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/518/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/292/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/474/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/188/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/171/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/292/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/22/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/223/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/227/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/274/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/402/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/463/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/538/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/551/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/567/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/627/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/257/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/451/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/532/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/292/?format=api" ], "ifbMembership": "Contributing platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "48.827419", "lng": "2.314518", "updated_at": "2024-03-11T14:58:57.583304Z" }, { "id": 16, "name": "BiRD", "logo_url": "https://pf-bird.univ-nantes.fr/images/logo/logo.svg", "description": "Le BiRD est cogéré par l'ITX et le LS2N, et emploie six biologistes computationnels. Grâce aux compétences de ce personnel dévoué et hautement qualifié, BiRD conseille, propose et développe des services bioinformatiques basés sur des données de séquençage à haut débit. Le BiRD possède une expertise dans l'analyse de données à grande échelle et a développé des flux de travail bio-informatiques dédiés qui normalisent le traitement des données brutes jusqu'à leur importance biologique. Sur la base de ces expertises, nous proposons à nos utilisateurs des formations sur l'analyse des données ou les langages de programmation. Ces services sont soutenus par une infrastructure de calcul et de stockage dédiée, accessible à distance via plusieurs services et ouverte à tous les scientifiques, quelle que soit leur institution d'accueil.", "expertise": [], "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.pf-bird.univ-nantes.fr/", "unitId": "", "address": "IRS UN, 8 Quai Moncousu", "city": "Nantes", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 30, "name": "UMR INSERM 1087", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/UMR%20INSERM%201087/?format=api" }, { "id": 31, "name": "CNRS 6291", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS%206291/?format=api" }, { "id": 32, "name": "UMS INSERM 016", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/UMS%20INSERM%20016/?format=api" }, { "id": 33, "name": "CNRS 3556", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS%203556/?format=api" }, { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "publications": [ "" ], "certifications": [ "Label IBiSA" ], "fundedBy": [ { "id": 52, "name": "CNRS", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS/?format=api" }, { "id": 56, "name": "INSERM", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=api" } ], "keywords": [ "Cloud", "Ecology", "Biodiversity", "Microbial ecology", "Metabolic engineering", "Multi-scale analysis and modelling", "Dynamic systems", "Ecological modelling", "Metagenomics", "Metabolic Network Modelling", "Machine learning", "Gene expression differential analysis", "metatranscriptomics", "Ontologies", "Panels (amplicons, captures)", "Exomes", "Variant analysis", "System modeling", "Systems Biology", "Interoperability", "Semantic web", "Knowledge mining", "Functioning of complex biological systems", "Regulatory network modelling", "Complete genomes", "Transcriptomics (RNA-seq)", "Integration of heterogeneous data", "Knowledge representation", "Cluster", "Computing Environments", "Data Integration", "Data management and transfer", "NGS Sequencing Data Analysis", "Données", "Toolkit", "Tool integration", "Workflow development", "Développements technologiques de l‘Information et de la Communication" ], "fields": [ "Biologie", "Biomédical", "Informatique" ], "orgid": null, "tools": [ "DEPIB", "microSysMics" ], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/69/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/520/?format=api" ], "technicalLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/54/?format=api" ], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/237/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/596/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/54/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/69/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/106/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/279/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/520/?format=api" ], "maintainers": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/237/?format=api" ], "ifbMembership": "Member platform", "platforms": [], "is_active": true, "closing_date": null, "lat": "47.209985", "lng": "-1.553544", "updated_at": "2024-03-11T16:00:19.368322Z" }, { "id": 24, "name": "South Green", "logo_url": "https://southgreenplatform.github.io/trainings//images/southgreenlong.png", "description": "South Green est une plateforme bioinformatique dédiée à la génomique des plantes tropicales et méditerranéennes et des pathogènes associés. Elle fédère des bio-informaticiens de différentes unités et instituts de Montpellier (Bioversity, CIRAD, INRA et IRD) ayant une expertise multidisciplinaire en intégration de données, développement de logiciels, analyse de données de séquençage et calcul haute performance. South Green assure le développement de systèmes d'information originaux tels que GreenPhyl, SNiPlay, Gigwa ou AgroLD, et propose des pipelines bio-informatiques via les gestionnaires de flux de travail Galaxy et TOGGLe. La plateforme a acquis une forte expertise dans le développement de Genome Hubs, des systèmes d'information intégrés, déployés sur plusieurs plantes et en cours d'extension aux pathogènes.", "expertise": [], "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.southgreen.fr", "unitId": "", "address": "Agropolis", "city": "Montpellier", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [ { "id": 50, "name": "CIRAD", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CIRAD/?format=api" }, { "id": 82, "name": "INRAE", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRAE/?format=api" }, { "id": 85, "name": "IRD", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IRD/?format=api" }, { "id": 86, "name": "the Alliance of Bioversity International and CIAT", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/the%20Alliance%20of%20Bioversity%20International%20and%20CIAT/?format=api" } ], "publications": [ 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somatiques et structuraux, nombre de copie, niveaux d'expression en RNA-‐seq) utile aux équipes biomédicales.\r\n \r\nPour remplir sa mission, la plateforme a développé une application Internet permettant d'assurer la gestion de grands projets multicentriques en toute transparence pour les collaborateurs. Elle a mis en place des procédures de contrôle qualité des échantillons à analyser. Elle dessine et automatise des pipelines d'analyse pour les données de génomique qu'elle reçoit.", "expertise": [], "linkCovid19": "", "homepage": "http://www.synergielyoncancer.fr/", "unitId": "", "address": "28 rue Laënnec\r\nFondation Synergie Lyon Cancer, Bât. Cheney D\r\n69008 Lyon\r\nFrance", "city": "Lyon", "country": "France", "communities": [], "projects": [], "affiliatedWith": [], "publications": [ "" ], "certifications": [], "fundedBy": [ { "id": 4, "name": "IFB", "url": "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IFB/?format=api" } ], "keywords": [ "Methodology", "Biostatistics", "CGH", "Expression", "DNA biochips", "RNA biochips", "Methylation profiles", "Genotyping", "Read alignment on genomes", "Gene expression regulation analysis", "Gene expression differential analysis", "Panels (amplicons, captures)", "Exomes", "Variant analysis", "Genome analysis", "Structural and functional annotation of genomes", "Complete genomes", "Transcript and transcript variant analysis", "Transcriptomics (RNA-seq)", "Genomics (DNA-seq)", "Genomics (Chips)", "NGS Sequencing Data Analysis" ], "fields": [ "Biologie", "Biomédical" ], "orgid": null, "tools": [], "services": [], "leaders": [], "deputies": [], "scientificLeaders": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/629/?format=api" ], "technicalLeaders": [], "members": [ "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/335/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/505/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/38/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/218/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/364/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/568/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/579/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/603/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/606/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/620/?format=api", "https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/629/?format=api" ], "maintainers": [], "ifbMembership": "None", "platforms": [], "is_active": false, "closing_date": "2023-03-15", "lat": "45.735673", "lng": "4.887571", "updated_at": "2024-03-11T14:43:54.424176Z" } ] }
