{"count":668,"next":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/event/?format=json&limit=20&offset=20&ordering=organisedByOrganisations","previous":null,"results":[{"id":651,"name":"Langage R : introduction","shortName":"","description":"Cette formation introduira le langage R et les techniques de fouille et de visualisation de données.\r\n\r\n- Installation et configuration de R\r\n- Notions et commandes essentielles (variables, fonctions...)\r\n- Les formats de fichiers, la lecture et l'écriture de données tabulées\r\n- Les outils de manipulation et de transformation de grands tableaux\r\n- Les constructions modernes pour la création de graphiques","homepage":"https://cnrsformation.cnrs.fr/catalogue/formation/43/langage-r-introduction/","is_draft":false,"costs":[],"topics":["http://edamontology.org/topic_0605"],"keywords":["R Language"],"prerequisites":["Linux - Basic 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les commandes de base permettant de lancer des programmes sous Linux\r\n- Comprendre et savoir lancer des scripts\r\n- Être capable d'écrire des scripts en Python\r\n- Acquérir de l'autonomie pour effectuer des analyses bioinformatiques qui combinent plusieurs outils \r\n\r\nPRÉREQUIS\r\n- Notions de base en informatique : fichiers, répertoires, etc. \r\n\r\nPROGRAMME\r\n- Linux : lignes de commandes, principales commandes, redirection\r\n- Lancer, créer et modifier des scripts\r\n- Notions de variables, de boucles, de choix\r\n- Programmation de scripts : utilisation de paramètres et de variables, combinaison d'outils et de logiciels, écriture des résultats dans un ou plusieurs fichiers\r\n- Création d'un pipeline d'outils","homepage":"https://cnrsformation.cnrs.fr/liste-stages-176-Bioinformatique.html","is_draft":false,"costs":["1200 €"],"topics":[],"keywords":["Linux","Python 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les données de spatialisation\r\n- Savoir intégrer les données de trajectoire\r\n- Savoir intégrer les données de communication cellulaire\r\n- Savoir intégrer les données d'épigénétique (ATAC-seq)","homepage":"https://cnrsformation.cnrs.fr/analyses-single-cell-rna-seq-scrna-seq-avec-r?axe=176","is_draft":false,"costs":[],"topics":[],"keywords":["Bioinformatics & Biomedical","R Language","R","NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":["Basic knowledge of R","R programming"],"openTo":"Everyone","accessConditions":"Maîtrise du langage R\r\nAvoir suivi le stage \"Langage R : introduction\" ou niveau équivalent.\r\nAfin de vérifier que votre maîtrise du langage R est suffisante pour pouvoir suivre ce stage, nous vous invitons à effectuer et à renvoyer le test téléchargeable\r\nhttps://cnrsformation.cnrs.fr/data/STG_23294_55153.docx","maxParticipants":12,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/154/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[{"id":6,"name":"CNRS formation entreprise","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/CNRS%20formation%20entreprise/?format=json"}],"organisedByOrganisations":[{"id":1,"name":"CNRS formation entreprises","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS%20formation%20entreprises/?format=json"}],"organisedByTeams":[{"id":6,"name":"CBiB","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/CBiB/?format=json"}],"logo_url":"https://services.cbib.u-bordeaux.fr/utils/logo_cbib.png","updated_at":"2025-12-09T10:10:11.677251Z","type":"Training 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impacts sur les analyses\r\n- Savoir choisir et utiliser les principaux outils d'analyse\r\n- Être autonome pour utiliser un pipeline d'analyse\r\n- Savoir manipuler les fichiers de séquences : préparation et filtration\r\n- Savoir évaluer la qualité des données\r\n- Savoir analyser les résultats avec ou sans génome de référence\r\n\r\nPRÉREQUIS\r\n- Notions de base en informatique : fichiers, répertoire...\r\n- Notions du système linux et des lignes de commande\r\n- Niveau master \r\n\r\nPROGRAMME\r\n- Linux : commandes de base\r\n- Les données NGS : fichiers, manipulation de base, nettoyage\r\n- Mapping : principaux outils et pratique\r\n- Transcriptomique :\r\n. analyse de RNA-seq : expression différentielle des gènes / des ARNs (comptage et DESeq2) ; comparaison d'échantillons issus de conditions différentes\r\n. post-analyse : analyse GO, interrogation bases de connaissances (ex : KEGG), création de graphique (en R)\r\n. analyse couplée transcriptome / traductome","homepage":"https://cnrsformation.cnrs.fr/liste-stages-176-Bioinformatique.html","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":[],"keywords":["NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"PUBLICS :\r\n- Biologistes, professionnels des sciences du vivant ayant besoin d'analyser des données de séquençage\r\n- Ingénieurs ou chercheurs en bioinformatique\r\n- Bioanalystes\r\n \r\nPRÉREQUIS\r\n- Notions de base en informatique : fichiers, répertoire...\r\n- Notions du système linux et des lignes de commande\r\n- Niveau master","maxParticipants":12,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/528/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[],"organisedByOrganisations":[{"id":1,"name":"CNRS formation 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en phylogénie moléculaire\r\n- Maîtriser les notions de base en statistiques (tests statistiques, principe du bootstrap, intervalles de confiances, etc.) et de probabilités (probabilités jointes / conditionnelles, théorème de Bayes, etc.)\r\n- Maîtriser un langage de programmation\r\n- Notions de phylogénie moléculaire\r\nAvoir suivi le stage \"Phylogénie moléculaire - formation de base\" ou niveau équivalent \r\n\r\nPROGRAMME\r\n- Phylogénétique et génétique des populations\r\n- Détection de sélection positive au sein de séquences codantes\r\n- Datation moléculaire : intégrer fossiles et molécules\r\n- Phylogénomique\r\n- Super-arbres et super-matrices, réconciliations d'arbres\r\n- Visualisation de l'information en phylogénie\r\n- Placement phylogénétique\r\n- Bases d'épidémiologie (modèles en compartiments, ODE, applications, etc)\r\n- Simulations selon une variété de modèles épidémiologiques\r\n- Phylodynamique : combiner épidémiologie et évolution","homepage":"https://cnrsformation.cnrs.fr/liste-stages-176-Bioinformatique.html","is_draft":false,"costs":["Priced","1200 €"],"topics":[],"keywords":["Phylogeny","Selection Detection","Phylogenomics"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"","maxParticipants":12,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/282/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[],"organisedByOrganisations":[{"id":1,"name":"CNRS formation entreprises","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/CNRS%20formation%20entreprises/?format=json"}],"organisedByTeams":[{"id":7,"name":"ATGC","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/ATGC/?format=json"}],"logo_url":"http://www.atgc-montpellier.fr/pictures/ATGClogo.svg","updated_at":"2023-10-05T12:36:32.255069Z","type":"Training 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