{"count":686,"next":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/event/?format=json&limit=20&offset=560&ordering=-organisedByTeams","previous":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/event/?format=json&limit=20&offset=520&ordering=-organisedByTeams","results":[{"id":411,"name":"4ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN","shortName":"EBA 2015","description":"La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers en session parallèle (RNA-seq, ChIP-seq, variants DNA-seq).\r\nL’école vise à introduire les concepts et à manipuler les outils informatiques et à en interpréter les résultats. Elle est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur plateforme.","homepage":"https://ressources.france-bioinformatique.fr/sites/default/files/programme-detaille-ecole-bioinfo-09-2015-2.pdf","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":[],"keywords":["Biostatistics","Sequence analysis","NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"","maxParticipants":40,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/207/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[{"id":3,"name":"IFB","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/IFB/?format=json"},{"id":13,"name":"Aviesan","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/Aviesan/?format=json"},{"id":14,"name":"Inserm","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/Inserm/?format=json"}],"organisedByOrganisations":[{"id":53,"name":"AVIESAN","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/AVIESAN/?format=json"},{"id":4,"name":"IFB - ELIXIR-FR","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IFB%20-%20ELIXIR-FR/?format=json"}],"organisedByTeams":[{"id":10,"name":"MIGALE","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/MIGALE/?format=json"},{"id":14,"name":"BiGEst","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/BiGEst/?format=json"},{"id":4,"name":"ABiMS","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/ABiMS/?format=json"},{"id":29,"name":"IFB Core","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/IFB%20Core/?format=json"}],"logo_url":"https://ressources.france-bioinformatique.fr/sites/default/files/EBA2016_0_1_1_0.jpg","updated_at":"2022-06-02T11:50:50.627601Z","type":"Training course","start_date":"2015-09-27","end_date":"2015-10-02","venue":"Station Biologique\r\nPlace Georges Teissier\r\n29680 Roscoff","city":"Roscoff","country":"France","geographical_range":"","trainers":[],"trainingMaterials":[],"computingFacilities":[],"realisation_status":"past","registration_opening":null,"registration_closing":null,"registration_status":"unknown","courseMode":"Onsite"},{"id":525,"name":"12ème Ecole de Bioinformatique AVIESAN-IFB-Inserm","shortName":"EBAII 2023 niv1","description":"La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de quatres ateliers thématiques en session parallèle (RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, single-cell), et inclura une introduction à l’intégration des données, une ouverture aux technologies “long reads”.\r\n\r\nL’école vise à introduire les concepts et à manipuler les outils informatiques et à en interpréter les résultats. Elle est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur plateforme.","homepage":"https://ifb-elixirfr.github.io/EBAII/","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":[],"keywords":["Biostatistics","Sequence analysis","NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). \r\nAucune connaissance préalable des environnements Linux ou R n’est requise, mais il sera demandé aux participants de suivre une autoformation en ligne en amont, pour faciliter la prise en main de ces langages. 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Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de trois ateliers en session parallèle (RNA-seq, ChIP-seq, variants DNA-seq), et inclura une introduction à l’intégration des données,  ouverture aux approches “single-cell” ainsi qu’aux technologies lectures longues (Nanopore, PacBio).\r\nL’école vise à introduire les concepts et à manipuler les outils informatiques et à en interpréter les résultats. Elle est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur plateforme.","homepage":"https://ressources.france-bioinformatique.fr/fr/formations/8%C3%A8me-%C3%A9cole-bioinformatique-aviesan-ifb","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":[],"keywords":["Biostatistics","Sequence analysis","NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). \r\nAucune connaissance préalable des environnements Linux ou R n’est requise, mais il sera demandé aux participants de suivre une autoformation en ligne en amont, pour faciliter la prise en main de ces langages. 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Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur plateforme.","homepage":"https://www.france-bioinformatique.fr/formation/ebaii-2021-n1/","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":[],"keywords":["Biostatistics","Sequence analysis","NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). \r\nAucune connaissance préalable des environnements Linux ou R n’est requise, mais il sera demandé aux participants de suivre une autoformation en ligne en amont, pour faciliter la prise en main de ces langages. 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Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques: elle s’articulera autour de quatres ateliers thématiques en session parallèle (RNA-seq, ChIP-seq/ATAC-seq, variants DNA-seq, single-cell), et inclura une introduction à l’intégration des données, une ouverture aux technologies “long reads”.\r\n\r\nL’école vise à introduire les concepts et à manipuler les outils informatiques et à en interpréter les résultats. Elle est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur plateforme.","homepage":"https://ifb-elixirfr.github.io/EBAII/","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":[],"keywords":["Biostatistics","Sequence analysis","NGS Sequencing Data Analysis"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"La formation s’adresse à des biologistes directement impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS). \r\nAucune connaissance préalable des environnements Linux ou R n’est requise, mais il sera demandé aux participants de suivre une autoformation en ligne en amont, pour faciliter la prise en main de ces langages. La formation approfondira progressivement l’usage de ces environnements au fil des sessions thématiques.","maxParticipants":40,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/624/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/642/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/371/?format=json","https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/134/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[{"id":3,"name":"IFB","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/IFB/?format=json"},{"id":13,"name":"Aviesan","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/Aviesan/?format=json"},{"id":14,"name":"Inserm","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/eventsponsor/Inserm/?format=json"}],"organisedByOrganisations":[{"id":53,"name":"AVIESAN","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/AVIESAN/?format=json"},{"id":56,"name":"INSERM","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INSERM/?format=json"},{"id":4,"name":"IFB - ELIXIR-FR","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/IFB%20-%20ELIXIR-FR/?format=json"}],"organisedByTeams":[{"id":10,"name":"MIGALE","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/MIGALE/?format=json"},{"id":14,"name":"BiGEst","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/BiGEst/?format=json"},{"id":4,"name":"ABiMS","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/ABiMS/?format=json"},{"id":29,"name":"IFB Core","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/IFB%20Core/?format=json"}],"logo_url":"https://moodle.france-bioinformatique.fr/pluginfile.php/1/core_admin/logocompact/300x300/1654772049/IFB-HAUT-COULEUR-PETIT.png","updated_at":"2023-05-17T10:08:18.619532Z","type":"Training course","start_date":"2023-11-05","end_date":"2023-11-10","venue":"","city":"Roscoff","country":"France","geographical_range":"","trainers":[],"trainingMaterials":[],"computingFacilities":[],"realisation_status":"past","registration_opening":"2023-03-01","registration_closing":"2023-05-31","registration_status":"closed","courseMode":"Onsite"},{"id":792,"name":"Analyse de données de métabarcoding - 2026","shortName":"Métabarcoding 2026","description":"Cette formation est dédiée à l’analyse de données de type “metabarcoding” issues de la technologie de séquençage Illumina. Nous aborderons les différentes étapes bioinformatiques nécessaires pour transformer les données de séquençage brutes en table d’abondances. Nous présenterons également les outils et méthodologies classiquement utilisés pour décrire la diversité observée et comparer les échantillons.\r\n\r\nA l’issue des 4 jours de formation, les stagiaires connaîtront le périmètre, les avantages et limites des analyses de données de séquençage amplicons (métabarcoding). Ils seront capables d’utiliser les outils de FROGS sur les jeux de données de la formation (16S et ITS) et sauront utiliser l’application Easy16S.\r\n\r\nIls seront capables d’identifier les outils et méthodes adaptées au cadre de leurs analyses. S’ils ont en leur possession un jeu de données à analyser, ils sont encouragés à venir avec celui- ci.\r\n\r\nProgramme :\r\n\r\n\r\nAnalyses bioinformatiques sous Galaxy\r\n\r\n    Introduction générale sur les données amplicons\r\n    Présentation et mise en application avec la suite FROGS du nettoyage des données, du clustering, de la détection de chimères, de l’assignation taxonomique et des étapes annexes\r\n    Conclusion, limite des méthodes, outils compagnons\r\n\r\nAnalyses statistiques avec Easy16S\r\n\r\n    Introduction générale\r\n    Import, manipulation et visualisation des données\r\n    Mesure de diversités : Unifrac, Bray-Curtis, etc.\r\n    Ordination et réduction de dimension : MDS\r\n    Clustering et Heatmap\r\n    Comparaison d’échantillons : PERMANOVA, adonis\r\n\r\nMise en application sur données personnelles ou publiques","homepage":"https://documents.migale.inrae.fr/trainings.html","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":["http://edamontology.org/topic_3697"],"keywords":["Metabarcoding"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"","maxParticipants":10,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/769/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[],"organisedByOrganisations":[{"id":82,"name":"INRAE","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRAE/?format=json"},{"id":88,"name":"BioinfOmics","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/BioinfOmics/?format=json"}],"organisedByTeams":[{"id":10,"name":"MIGALE","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/MIGALE/?format=json"}],"logo_url":"https://migale.inrae.fr/sites/default/files/migale-orange_0.png","updated_at":"2026-02-12T10:55:22.536502Z","type":"Training course","start_date":"2026-06-08","end_date":"2026-06-11","venue":"","city":"Jouy-en-Josas","country":"France","geographical_range":"","trainers":[],"trainingMaterials":[],"computingFacilities":[],"realisation_status":"past","registration_opening":null,"registration_closing":"2026-05-25","registration_status":"closed","courseMode":"Onsite"},{"id":791,"name":"Annotation et comparaison de génomes bactériens - 2026","shortName":"Annotation et comparaison de génomes bactériens 2026","description":"Connaître les concepts et les principales méthodes bioinformatiques pour annoter automatiquement et comparer un jeu de données de génomes bactériens. Construire et évaluer la qualité d’un jeu de données publiques. Évaluer la qualité et annoter automatiquement un jeu de données. Savoir mettre en oeuvre une comparaison de génomes et en interpréter les résultats.\r\n\r\nProgramme :\r\n\r\n* Construction d’un jeu de données :\r\n        Téléchargement de données publiques\r\n        Evaluation de la qualité d’un jeu de données\r\n\r\n* Principes et mise en œuvre d’une annotation automatique d’un génome bactérien\r\n\r\n * Caractérisation de la diversité génomique\r\n\r\n * Construction de pangénomes\r\n\r\n * Analyse des résultats :\r\n        Résultats et métriques d’un pangénome\r\n        Notions élémentaires de phylogénomique\r\n        Visualisation et interprétation des résultats\r\n\r\n * Mise en pratique sur un jeu de données bactériens, utilisation des logiciels dRep, Quast, Bakta et PPanGGOLiN sous Galaxy.","homepage":"https://documents.migale.inrae.fr/trainings.html","is_draft":false,"costs":["Priced"],"topics":["http://edamontology.org/topic_3299","http://edamontology.org/topic_0622","http://edamontology.org/topic_0797"],"keywords":["Genome annotation","Comparative genomics"],"prerequisites":[],"openTo":"Everyone","accessConditions":"","maxParticipants":10,"contacts":["https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/userprofile/769/?format=json"],"elixirPlatforms":[],"communities":[],"sponsoredBy":[],"organisedByOrganisations":[{"id":82,"name":"INRAE","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/INRAE/?format=json"},{"id":88,"name":"BioinfOmics","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/organisation/BioinfOmics/?format=json"}],"organisedByTeams":[{"id":10,"name":"MIGALE","url":"https://catalogue.france-bioinformatique.fr/api/team/MIGALE/?format=json"}],"logo_url":"https://migale.inrae.fr/sites/default/files/migale-orange_0.png","updated_at":"2026-02-12T10:46:56.602216Z","type":"Training course","start_date":"2026-03-19","end_date":"2026-03-20","venue":"","city":"Jouy-en-Josas","country":"France","geographical_range":"","trainers":[],"trainingMaterials":[],"computingFacilities":[],"realisation_status":"past","registration_opening":null,"registration_closing":"2026-03-05","registration_status":"closed","courseMode":"Onsite"}]}